南方科技大學(xué)附屬中學(xué)是一所以科技創(chuàng)新教育為主要特色，兼具人文精神的國際化、信息化的創(chuàng)新型高中。學(xué)校在深圳市教育局和南方科技大學(xué)的領(lǐng)導(dǎo)下，依托南科大優(yōu)質(zhì)教育資源，與南科大進(jìn)行精準(zhǔn)有效的教育銜接，探索高中-高校貫通式人才培養(yǎng)模式，為未來社會(huì)培養(yǎng)德智體美勞全面發(fā)展的優(yōu)秀人才。2020年秋，南科大附中招收首批700名榮譽(yù)學(xué)生（含自主招生50名），當(dāng)年中考錄取分?jǐn)?shù)線創(chuàng)下深圳市近年來新辦高中學(xué)校最高錄取分?jǐn)?shù)線的紀(jì)錄，創(chuàng)校當(dāng)年即躋身深圳市公辦高中前列。2021年，南科大附中招收第二屆榮譽(yù)學(xué)生800名（含自主招生80名），在招生錄取分?jǐn)?shù)線高起點(diǎn)的基礎(chǔ)上，在深圳市眾多名校激烈競爭中再進(jìn)2名（第12名），取得了可喜的進(jìn)步。南科大附中在全國知名校長王佩東帶領(lǐng)下，已組建起一支高學(xué)歷、高素養(yǎng)、高水平的精英教師和管理團(tuán)隊(duì)。學(xué)校將在南科大雄厚教育資源的支持下，努力把學(xué)校辦成一所有別于傳統(tǒng)名校的未來學(xué)校、一所學(xué)術(shù)性研究型世界一流高中。
在做好國家課程校本化實(shí)施的基礎(chǔ)上，學(xué)校已經(jīng)初步建立起常規(guī)課、綜合課、選修課、競賽課、榮譽(yù)課、大學(xué)先修課、院士大講堂等學(xué)科拓展課程、公共選修課程、綜合實(shí)踐課程、系列微型課程相結(jié)合的校本課程體系框架。學(xué)校將社團(tuán)活動(dòng)、綜合實(shí)踐活動(dòng)納入學(xué)校課程體系，通過開展軍訓(xùn)、南科少年好聲音、藝術(shù)沙龍、學(xué)科節(jié)等活動(dòng)，豐富校園生活，展示青春風(fēng)采，提升學(xué)生綜合素質(zhì)。
學(xué)校所申報(bào)的深圳市重大資助課題《構(gòu)建創(chuàng)新人才培養(yǎng)新機(jī)制》和重點(diǎn)資助課題《中小學(xué)加強(qiáng)科技創(chuàng)新教育研究》獲批立項(xiàng)。課題《未來學(xué)校組織形態(tài)與制度重構(gòu)的理論與實(shí)踐研究》通過市專家組評(píng)審，作為國家重大項(xiàng)目上報(bào)國家課題規(guī)劃辦。